转录辅助因子对不同类型的核心启动子具有选择性

2021-12-13 04:24:38 来源:

基因表达辅助表征（transcriptional cofactor， COF）在增强子与操纵子二者之间传递调控蛛丝马迹，是基因表达诱导和DNA表达的两大效应器皿。虽然已断定某些COF比其他COF不够偏爱某些操纵子类别，但是相异COF对相异操纵子标示出显露的内在特异性的程度由此可知不确实。在一项在此之后数据分析中，来自奥地利柏林生器皿中心分子药理学数据分析所的数据分析工作人员在黑腹小鼠S2肝细胞中使用小分子操纵子活性测定来选取23个COF诱导7.2万个候选两大操纵子（core promoter， CP）的灵活性。具体数据分析结果于2019年5月底15日的网站刊登在Nature期刊上，科学论文曲名为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些数据分析工作人员观察到两大操纵子的相异诱导，这声称COF与特定类别的两大操纵子二者之间存有着相异的调节偏爱或者说“一致性（compatibilities）”。这些功能性相异的两大操纵子在TATA盒、上游操纵子电子元件（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等已知的DNA序列电子元件上相异性地富含，并在人体内位点上标示出显露相异的染色质特性。值得注意的是，这些两大操纵子类别在它们的H3K4me3和H3K4me1记号上存有相异的相对数量级，这声称这些组蛋白去除可能会必需区分环己烷调节表征而不是操纵子和增强子类别的顺式调节电子元件。这些数据分析工作人员断定在人肝细胞和另外两种小鼠肝细胞中断定了相异COF-两大操纵子一致性的存有。为此，他们发现了分别偏爱TATA盒和CpG岛操纵子的COF。COF和两大操纵子二者之间的相异一致性必需解释相异的增强子如何特异性地诱导相异组的DNA、不尽相同DNA内的如前所述操纵子（alternative promoter）和不尽相同操纵子内的相异基因表达起始位点。综上所述，COF-两大操纵子一致性可能会是小鼠和人类等相异器皿种中相异基因表达计算机系统的基础。原始显露处：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]